Der Rundgang durch die neun Ausstellungsbereiche gleicht einer Reise durch die Kulturgeschichte der Schokolade: beginnend bei den altamerikanischen Kulturen wie den Maya und den Azteken, über das Barockzeitalter und die Industrialisierung – bis zur individuellen Verfeinerung edler Schokoladen heute. Erfahrbar gemacht wird dies durch ein begehbares Tropenhaus, naturkundliche Informationen zum Kakao, und verschiedene Exponate der genannten Zeitalter, wie z. B. eine Silbersammlung oder zahlreiche alte Maschinen. Im Schokoladenatelier kann der Besucher erleben, wie Schokoladenprodukte ganz individuell von Hand hergestellt werden.

Wie Schokolade heute verarbeitet wird, zeigt der Produktionsbereich, der im „Bug“ des schiffsähnlichen Museumsgebäudes untergebracht ist und auch den eigens für das Museum gebauten, kunstvollen Schokoladenbrunnen beherbergt. Gefüllt mit 200 Kilogramm warmer, flüssiger Schokolade sprudelt aus zehn Edelstahlfontänen Lindt Schokolade in die Brunnenschale. Der Produktionsbereich umfasst neben dem Schokoladenbrunnen eine komplette Einheit zur Verarbeitung der Kakaobohne: über das Rösten, Brechen und Mahlen bis hin zur fertig gemischten, gewalzten und conchierten Schokoladenmasse. Eine Eintafelanlage, die Trüffelherstellung und Hohlfigurenproduktion lassen ahnen, zu welchen Köstlichkeiten Schokolade weiterverarbeitet werden kann. Rund 400 Kilogramm Schokolade werden in dieser maßstabgetreu verkleinerten Mini-Anlage täglich verarbeitet. Besucher können sich hier ihre individuelle Schokoladentafel aus drei Sorten Lindt Schokolade und 40 Zutaten zusammenstellen.